細胞周期学

哺乳類レトロトランスポゾンがゲノムを改変する分子機構と疾患発症との関係解明

細胞認識学

個体成長・生殖・老化における栄養環境適応や共存微生物叢の研究

遺伝子特性学

変動する地球環境に対する植物の生存戦略を発生進化の観点で探る

全能性統御機構学

ケミカルバイオロジーと分子細胞生物学の融合により植物成長の謎を解く

生体情報応答学

健康生活に繋がる、天然由来有用生理活性物質やミネラルの研究

微生物細胞機構学

相分離現象とCO2濃縮機構を基盤とする光合成生物の生存戦略の解明

分子応答機構学

宿主と腸内細菌の共生・共進化を細菌代謝の観点から考える

分子代謝制御学

植物の環境応答と有性生殖（開始から完了まで）の分子機構の研究

神経発生学

哺乳類脳の皮質構築過程を分子・細胞・組織のレベルで明らかにする

細胞動態生化学

生命現象に関わる因子をスクリーニングにより同定し疾患との関係を解明

多元生命科学

細胞・ゲノムなどの生物システムの動作原理の解明

微細構造ウイルス学

インフルエンザウイルス・エボラウイルス・ラッサウイルスの増殖機構の解析および治療法の開発

遺伝子伝達学

細胞増殖を制御する遺伝子群の分裂酵母を材料とした解析

遺伝子動態学

食用の繊維状シアノバクテリア（スピルリナ）の研究

分子情報解析学

細胞内環境におけるタンパク質複合体や非膜小器官の構造・機能的ダイナミクスを、生物物理学、分子生物学、細胞生物学的手法で明らかにする

分子動態生理学

分子を観て生命の謎を考えよう〜細胞力覚から薬の臨床まで

生体システム学

受容体を介した栄養や性差に関連する高次生命現象の解明

システム機能学

細胞間の競合と協調による生体制御とがん発生のメカニズム

生体制御学

大人の神経幹細胞の「休眠」をタンパク質恒常性の観点から探る

脳機能発達再生制御学

哺乳類の脳の発生・発達機構と幹細胞生物学に基づいた神経再生医学研究

ゲノム維持機構学

染色体に魅せられこだわり、その構造と均等分配に必要な仕組みについて研究

がん細胞生物学

腫瘍内の低酸素環境ががんを悪性化する機序の解明

生体動態制御学

RNAウイルス学、内在性ウイルス研究、ウイルスベクター開発

細胞増殖統御学

妊娠・再生・老化における臓器適応機構の解明と創薬基盤の開発

生体適応力学

実験・数理融合による生体システムの多階層バイオメカニクス研究

生体応答学

マウスを使った免疫機構の解明とヒト疾患治療への応用

染色体継承機能学

精子・卵子をつくる減数分裂の原理を理解し、不妊問題の理解に貢献

クロマチン動態制御学

生物学と数理アプローチの融合研究によるストレス応答機構の解明

分子病態学（北島研究室）

哺乳類の卵母細胞における染色体分配およびその老化の研究

分子病態学（髙里研究室）

ヒト多能性幹細胞からのオルガノイド開発とヒト器官発生の理解

分子病態学（王研究室）

シナプスと認知機能における脳内RNA修飾の役割の解明

分子病態学（小幡研究室）

各種栄養素や腸内細菌の生理機能の研究と、食餌による動物の健康寿命制御機構の解明